A Mezőgazdasági Szakigazgatási Hivatal (a továbbiakban: MgSzH) a kormány központi hivatala. Az MgSzH-t a földművelésügyi és vidékfejlesztési miniszter irányítja. Az MgSzH önállóan gazdálkodó, az előirányzatok felett teljes jogkörrel rendelkező költségvetési szerv, melyet elnök vezet, székhelye Budapest.

Az MgSzH központi szerve a Mezőgazdasági Szakigazgatási Hivatal Központja (a továbbiakban: Központ), székhelye Budapest. Az MgSzH Központja az egész országra kiterjedő illetékességgel rendelkezik, az MgSzH területi szerveinek illetékességi területe a nevükben megjelölt közigazgatási területre terjed ki. A területi szerveknek feladatainak megfelelő ellátása és ügyfélszolgálat biztosítása érdekében körzeti irodákat kell működtetnük.

Az MgSzH-t a kormány

- növénytermesztési hatóságként,
- talajvédelmi hatóságként,
- állategészségügyi hatóságként,
- tenyésztési hatóságként,
- erdészeti hatóságként,
- vadászati hatóságként,
- halászati hatóságként,
- takarmányozási hatóságként,
- borászati hatóságként,
- növényvédelmi szervként,
- mezőgazdasági igazgatási szervként

jelölte ki.

Egyúttal az MSzGH jogutódlásával 2007. január 1. napján megszűntek:

- a fővárosi és megyei növény- és talajvédelmi szolgálatok,
- a Növény- és Talajvédelmi Központi Szolgálat,
- a fővárosi és megyei állategészségügyi és élelmiszer-ellenőrző állomások,
- az Országos Mezőgazdasági Minősítő Intézet,
- az Állami Erdészeti Szolgálat,
- a Földművelésügyi Költségvetési Iroda,
- az Országos Borminősítő Intézet,
- az Állatgyógyászati Oltóanyag-, Gyógyszer- és Takarmányellenőrző Intézet,
- az Országos Állategészségügyi Intézet és
- az Országos Élelmiszervizsgáló Intézet.